quarta-feira, 7 de abril de 2010

LIMI com menção honrosa em bio-informática


Um trabalho com colaboração do LIMI foi aceito para uma conferência internacional em e-health:
"Congratulations - your paper #1569284381 ('Artificial Neural Networks And Bayesian Networks As Supporting Tools For Diagnosis Of Asymptomatic Malaria') for IEEE-Healthcom2010 has been accepted."
e receberá menção honrosa num congresso de informática nacional, a ERBASE 2010. Este é o trabalho de conclusão de curso de Austeclino, aluno do Prof. Angelo Duarte, que utiliza dados da tese de Bruno Andrade em malária. Um exemplo interessante de colaboração entre áreas distintas.
“Prezado(a) autor(a),
Temos a satisfação de informar que seu artigo receberá uma menção honrosa durante a ERBASE 2010 devido a qualidade do trabalho, atestada pelo nosso comitê de programa. Parabéns!”...
Trilha de TCC
#65156: Sistema Especialista De Apoio Ao Diagnóstico Da Malária Assintomática Baseado Em Redes Neurais Artificial
Austeclino Júnior (FRB),
Angelo Duarte (UEFS),
Bruno Andrade (Fundação Oswaldo Cruz)
Manoel Barral (Fundação Oswaldo Cruz)”
Com uma ênfase maior na parte biológica, este material consta de um manuscrito sobre diagnóstico da malária e que deverá ser publicado em breve.

Ilustração de Bruno Andrade.

terça-feira, 6 de abril de 2010

Universidade Federal da Bahia e a avaliação do MEC



Este post trata do desempenho da UFBA, a maior e mais antiga universidade na Bahia, na avaliação feita pelo MEC através do cálculo do Índice Geral de Cursos (IGC; abaixo há um texto do INEP sobre o cálculo do IGC). No dia 13 de março passado, a imprensa divulgou os resultados de uma ampla revisão feita pelo INEP nos IGC calculados anteriormente, chamando de novo a atenção para o problema.
A UFBA tem se situado em torno no 350 lugar no cômputo geral e exibiu uma piora no desempenho nas avaliações divulgadas. Ainda é mais grave o fato das universidades estaduais paulistas não participarem da avaliação. Caso participassem, esperar-se-ia que a UFBA estivesse em torno do 400 posto. 
Não é uma situação apropriada nem para sua história nem para o futuro da Bahia. Agrava a situação o fato da posição relativa da UFBA não demonstrar melhora. Pelo que tem sido divulgado internamente, esperava que a posição da UFBA fosse bem mais expressiva. 
Realmente será necessário um esforço importante de diversos segmentos da sociedade baiana para promover a melhora do ensino superior na Bahia. A ciência e tecnologia são fundamentais para o desenvolvimento e o sistema educacional é responsável pela formação de doutores. Os índices educacionais da Bahia são péssimos na sua comparação com outros estados e isto ainda é mais grave quando sabemos que o desempenho do Brasil é baixo internacionalmente.  Todo o sistema educacional da Bahia precisa ser melhorado vigorosamente. 
O que o IGC parece indicar é que a UFBA não aproveitou adequadamente a grande expansão promovida no ensino superior brasileiro durante o governo Lula. Para evitar a síndrome de Fitzcarraldo, é importante discutir como reverter a situação. A época de campanha para novo Reitor deve motivar reflexões profundas.
“Índice Geral de Cursos (IGC)
O Índice Geral de Cursos (IGC) é uma média ponderada dos conceitos dos cursos de graduação e pós-graduação da instituição. Para ponderar os conceitos, utiliza-se a distribuição dos alunos da IES entre os diferentes níveis de ensino (graduação, mestrado e doutorado). O IGC será utilizado, entre outros elementos e instrumentos, como referencial orientador das comissões de avaliação institucional.
O conceito da graduação é calculado com base nos Conceitos Preliminares de Cursos (CPC) e o conceito da pós-graduação é calculado a partir de uma conversão dos conceitos fixados pela CAPES.
Vale dizer que nas instituições sem cursos ou programas de pós-graduação avaliados pela CAPES, o IGC é simplesmente a média ponderada dos cursos de graduação.
Para a ponderação das matrículas da graduação, são utilizados dados dos Censos da Educação Superior. Para ponderação da pós-graduação, são utilizados os dados de matrículas da CAPES.”

segunda-feira, 5 de abril de 2010

Sete erros frequentes em epidemiologia


ResearchBlogging.org
Para quem trabalha com populações humanas (isto inclui grupos de pacientes) recomendo a leitura do artigo Seven mistakes and potential solutions in epidemiology, including a call for a World Council of Epidemiology and Causality publicado no Emerging Themes in Epidemiology (2009, 6:6) e que foi classificado como Highly accessed.
O artigo indica sete áreas de erros frequentes no relato de estudos epidemiológicos. Ver os exemplos e as formas de corrigi-los pode ser bastante útil para todos os que escrevem artigos que relatam estudos com populações ou grupos populacionais.
Os erros principais e suas soluções:

Erro
Solução
Failing to provide the context and definitions of study populations
Describe the study population in detail
Insufficient attention to evaluation of error
Don't pretend error does not exist
Not demonstrating comparisons are like-for-like
Start with detailed comparisons of groups
Either overstatement or understatement of the case for causality
Never say this design cannot contribute to causality or imply causality is ensured by your design
Not providing both absolute and relative summary measures
Give numbers, rates and comparative measures, and adjust summary measures such as odds ratios appropriately
In intervention studies not demonstrating general health benefits
Ensure general benefits (mortality/morbidity) before recommending application of cause-specific findings
Failure to utilise study data to benefit populations
Establish a World Council on Epidemiology to help infer causality from associations and apply the work internationally
Leia o artigo com exemplos e comentários que ajudam muito.

Bhopal, R. (2009). Seven mistakes and potential solutions in epidemiology, including a call for a World Council of Epidemiology and Causality Emerging Themes in Epidemiology, 6 (1) DOI: 10.1186/1742-7622-6-6

domingo, 4 de abril de 2010

Defesa de Tese de Bruno de Bezerril Andrade

No dia 29 de abril, Bruno de Bezerril Andrade defendeu a sua tese de Doutorado com o título: Identificação de potenciais determinantes imunológicos de gravidade na malária humana.

A banca foi composta pelos Drs.: Antoniana Krettli, Edgar Marcelino de Carvalho Filho, Marilda Gonçalves, Mitermayer Reis e Manoel Barral-Netto (orientador).

Os diapositivos da apresentação de Bruno estão mostrados abaixo:


Não acertei a colocar o vídeo sem cortar parte dos diapositivos (se alguém souber como corrigir, favor colocar nos comentários), assim é melhor ver diretamente no YouTube aqui.
Procurei no são google e achei uma solução. Agora ficou menor que poderia.... e tem que alterar o HTML. Se alguém souber de forma mais fácil, agradeço a ajuda.

Webminar sobre Tuberculose do Scientists without Border

A organização Scientists Without Borders, juntamente com a New York Academy of Science, promoverá um webminar sobre tuberculose na 3a-f próxima, 06 de abril.
Tuesday, APRIL 6, 2010 • 1:00 PM - 5:30 PM (EST)
Tuberculosis: Novel Therapies through Knowledge of the Genetics of the Causative Agent

Tuberculosis kills close to two million people each year and infecting strains of Mycobacterium tuberculosis resistant to standard regimens are increasingly more prevalent. There is a clear need for new TB drugs and for new drug discovery paradigms. It has been more than 10 years since the sequence of M. tuberculosis genome was published. The accumulated knowledge from the intervening years, together with recent use of innovative genetic techniques, has shifted the emphasis in TB drug discovery from empirical approaches to hypothesis-driven processes. These new processes can accelerate identification and validation of pharmaceutical targets, unveil resistance mechanisms, and present new compound screening strategies and drug development pathways. This symposium will highlight recent advances in these areas as well as deeper insights into the pathophysiology of the disease that has been enabled by genetic tools.


This symposium will also be broadcast as a live webinar, providing an opportunity for our world-wide audiences to participate in this exciting and timely discussion.
To Register For This Webinar & For More Information www.nyas.org/TB