eTBLAST contra o plágio

O problema do plágio científico tem aumentado no mundo todo. Um post recente no blog da National Association of Science Writers (Uncovering Plagiarism in Biomedical Research) diz:

“Like any other professional, scientists sometimes engage in unethical research conduct. Many technical medical editors are indifferent to plagiarism; non-plagiaristic fraud is relatively common in biomedical and clinical research; scientists often do not comply with the data sharing requirements of open-access journals.”

Já divulgamos duas vezes no Sciencia Totum o programa de busca de textos similares denominado e-TBLAST. “busca de textos similares no Medline. A busca é feita pela similaridade de texto. Enquanto o Pubmed busca por palavras-chave, no eTBLAST você pode colocar um parágrafo inteiro.

Qual a vantagem?

Você não precisa escolher palavras precisas. Coloca o texto todo e a busca tende a ficar mais precisa pois encontra artigos relacionados que trazem as mesmas palavras.”

Recentemente um artigo na PLoS One (Systematic Characterizations of Text Similarity in Full Text Biomedical Publications) utilizou o e-TBLAST para detectar plágio.

O e-TBLAST foi muito efieinte para detectar textos similares. Esta similaridade foi mais frequente na Introdução e no Material e Métodos. Nem sempre a similaridade encontrada foi considerada plágio, por diversos motivos. Quanto a similaridade foi encontrada nos Resultados, a frequencia de plágio foi mais elevada.

Um dado interessante é o achado que a similaridade do resumo se correlaciona com similaridade no texxto completo (figura acima).

O que devemos recomendar? O e-TBLAS é um programa de uso livre, assim devemos mesmo checar nossos textos antes de publicar. Principalmente agora que até uma cópia do seu próprio texto pode ser considerada plágio e motivo para retirada (retraction) do artigo.

Previamente, discutimos a fraude e o plágio cientifico no Totum:

A fraude científica é epidêmica na China? só na China?

Pesquisadores da USP denunciados por fraude

Fraude nas células tronco

Plágio na era do cortar e colar

Cancelamento de artigos em elevação

Fake journal: Revista científica “falsificada”

Quantos falsificam dados científicos?

Fraude científica

Ilustração acima do texto: Figura 1 da publicação citada.

Ilustração no corpo do texto.

Sun, Z., Errami, M., Long, T., Renard, C., Choradia, N., & Garner, H. (2010). Systematic Characterizations of Text Similarity in Full Text Biomedical Publications PLoS ONE, 5 (9) DOI: 10.1371/journal.pone.0012704

Bio-text, excelente recurso: Procura de textos científicos com figuras e tabelas

Não sei o que vocês pensam, mas uma das primeiras coisas que procuro numa publicação são as figuras. Delas depende muito a minha decisão de ler ou não o artigo completo. Contudo a maioria das buscas não nos dá uma preview das figura; aparece título, autores e revistas. Abrir cada um deles consome bastante tempo. Assim, nossa decisão de buscar o artigo completo depende muito do prestígio da revista e do autor e do título.

Há, já algum tempo, foi lançado o Bio-text, uma ferramenta de busca de textos científicos permite buscar o resumo, figuras com legendas e tabelas para uma visão prévia. O programa, livre, busca em artigos da área biológica publicados em revistas com acesso livre.

“Developed as part of the BioText project at the University of California, Berkeley, the BioText Search Engine is a freely available Web-based application that provides biologists with new ways to access the scientific literature.

The interface has been carefully designed according to usability principles and techniques. The system uses Lucene for the underlying indexing, and users can use all the Lucene operators in their search queries.

The search engine is a work in progress and more functionality is being added over time.”

Os responsáveis pelo Bio-Text publicaram recentemente na PLoS One um artigo ("Full Text and Figure Display Improves Bioscience Literature Search"; doi 10.1371/ journal.pone.0009619) sobre o uso do Bio-Text. Nele descobri que estou com a maioria, 19 dos 20 participantes desejam que um programa de busca que apresente as figuras, além dos resultados de texto.

Um ponto importante é que para que um sistema deste funcione é necessário que os artigos sejam publicados em acesso livre, pois exige acesso ao texto completo dos documentos e das restrições para mostrar figuras.

Há pouco republicamos um post sobre um outro sistema de busca por textos científicos similares, o eTBLAST.

Divoli, A., Wooldridge, M., & Hearst, M. (2010). Full Text and Figure Display Improves Bioscience Literature Search PLoS ONE, 5 (4) DOI: 10.1371/journal.pone.0009619

Procura de textos científicos similares

Esta é uma republicação de post do ano passado, que acho que teve pouco uso, apesar de sua importância:

Dica rápida sobre um instrumento (eTBLAST) de busca de textos similares no Medline. A busca é feita pela similaridade de texto. Enquanto o Pubmed busca por palavras-chave, no eTBLAST você pode colocar um parágrafo inteiro.

Qual a vantagem?

Você não precisa escolher palavras precisas. Coloca o texto todo e a busca tende a ficar mais precisa pois encontra artigos relacionados que trazem as mesmas palavras.

Onde pode usar?

Ao preparar o Abstract de um novo artigo você pode fazer um blast do texto e ver se não esqueceu algum artigo com texto similar, e com grande chance de ser relevante.

Em breve o eTBLAST incluirá busca de patentes do USPTO.

Um artigo recente da Nature, relata o uso do eTBLAST para identificar o problema ético de cópia de texto (plágio) em artigos científicos: “Are scientists publishing more duplicate papers? An automated search of seven million biomedical abstracts suggests that they are.”

Bom uso!

Ilustração: de D. Parkins