quinta-feira, 30 de junho de 2011

Macrófagos com inclusões lipídicas fornecem um ambiente ideal para a latência de Mycobacterium tuberculosis




ResearchBlogging.org

Post de Theolis Bessa

Pouco se sabe acerca dos mecanismos envolvidos na entrada em latência deste bacilo que infecta silenciosamente um terço da população mundial, e é responsável pela morte de quase dois milhões de pessoas por ano em todo o mundo. A infecção por M. tuberculosis apresenta uma eficiência impressionante: 1-10 bacilos são capazes de estabelecer a infecção nos pulmões de um indivíduo exposto aos aerossóis produzidos pela tosse de um paciente com a forma pulmonar da tuberculose. Apenas 15-20% dos indivíduos desenvolve a tuberculose imediatamente após a infecção inicial; a grande maioria dos indivíduos permanecerá infectada por toda a vida sem manifestar a doença (tuberculose latente) e 10% apresentarão a doença por reativação após um período variável de latência [1].

O artigo de Daniel e colaboradores [2] explora o fato de que o acúmulo de tracilglicerol (TAG), que ocorre para prover uma fonte de reserva energética em vários organismos durante e após a latência/hibernação, foi observado em isolados clínicos de M. tuberculosis e em macrófagos humanos cultivados sob hipóxia, em condições que mimetizariam as encontradas no granuloma (1% O2). Os autores demonstram que macrófagos infectados com M. tuberculosis mantidos sob hipóxia acumulam TAG que depois é metabolizado e seus ácidos graxos são incorporados a vários lipídeos micobacterianos (TAG, lipídeos polares, ésteres de ceras) dentro da bactéria, em um processo que envolve em grande parte a atividade da principal enzima envolvida na síntese de triacilglicerol em micobactérias, a triacilglicerol sintase 1 (ts1). Em macrófagos infectados sob condições de hipóxia as micobactérias apresentaram várias características associadas à latência, como replicação diminuída, indução da expressão de genes associados ao metabolismo lipídico, stress e dormência, resistência à rifampicina e isoniazida, diminuição da proporção de células coráveis por Auramina-O e aumento da proporção de células coráveis por Nile Red, o que não foi observado em bacilos provenientes de culturas de macrófagos infectados mantidos sob normóxia.

Os achados contribuem para a compreensão dos mecanismos que permitem a sobrevivência do M. tuberculosis no indivíduo infectado e amplia as perspectivas para a investigação de drogas capazes de agir sobre o bacilo no estágio de latência, o que permitiria a profilaxia da doença e o controle da transmissão para outros hospedeiros.

Referências:

[1] S.H.E. Kaufmann, Future Vaccination Strategies against Tuberculosis: Thinking outside the Box, Immunity. 33 (2010) 567-577.

[2] Daniel, J., Maamar, H., Deb, C., Sirakova, T., & Kolattukudy, P. (2011). Mycobacterium tuberculosis Uses Host Triacylglycerol to Accumulate Lipid Droplets and Acquires a Dormancy-Like Phenotype in Lipid-Loaded Macrophages PLoS Pathogens, 7 (6) DOI: 10.1371/journal.ppat.1002093

quarta-feira, 29 de junho de 2011

Receptores do macrófago e entrada da Leishmania

Post de Marcia Weber (LIP-CPqGM/FIOCRUZ)


ResearchBlogging.org



Differences in human macrophage receptor usage, lysosomal fusion kinetics and survival between logarithmic and metacyclic Leishmania infantum chagasi promastigotes

A Leishmania infantum chagasi (Lic) é um parasita intracelular obrigatório que é fagocitado por macrófagos. Alguns receptores estão envolvidos neste processo como o terceiro receptor do complemento (CR3) e o receptor de manose (MR). Existem evidências que, ao se ligar a estes receptores, o parasito não ativa a via clássica dos macrófagos, podendo então sobreviver dentro da célula. No presente trabalho, os autores buscam comparar os mecanismos de entrada e os caminhos de tráfico intracelular entre as formas estacionárias e metacíclicas. Para isso, eles infectam macrófagos derivados de monócitos humano (MDM) com promastigotas metacíclicas ou com promastigotas estacionárias. Em diferentes tempos, eles utilizam microscopia confocal para análises. Primeiramente, eles demonstram que promastigotas metacíclicas e estacionárias entram nos MDMs pelo CR3, porém apenas os estacionários entram através de vacúolos contendo MR. Outro trabalho reportou que Lic entra nos MDMs via caveolina, que são microdomínios de membranas ricos em colesterol responsáveis por atrasar a fusão de lisossomos. Assim, os autores evidenciaram que promastigotas metacíclicas colocalizam-se com a caveolina e não acumulam proteína de membrana associadas a lisossomos (LAMP-1) no inicio da infecção, enquanto as promastigotas estacionárias sim. Os MDMs fagocitaram um número muito maior de promastigotas estacionárias, porém as metacíclicas replicaram intracelularmente com maior eficiência. Assim, estes resultados sugerem que promastigotas metacíclicas não se ligam a MR e entram por um caminho que potencializa sua sobrevivência na célula. Portanto, este trabalho elucida caminhos e mecanismos utilizados pelo parasita para infecção que podem ser alvos para terapias. Pra mim, este trabalho chama atenção para os experimentos in vitro. Uma vez que há diferenças importantes na Leishmania metacíclica ou estacionária, até que ponto podemos utilizar as culturas com resultados plausíveis.

Ueno N, Bratt CL, Rodriguez NE, & Wilson ME (2009). Differences in human macrophage receptor usage, lysosomal fusion kinetics and survival between logarithmic and metacyclic Leishmania infantum chagasi promastigotes. Cellular microbiology, 11 (12), 1827-41 PMID: 19702651

terça-feira, 28 de junho de 2011

Peer Review - Revisão por Pares

Any jackass can trash a manuscript, but it takes good scholarship to create one(how MBoC promotes civil and constructive peer review)



Com este título provocativo (algo como "qualquer um pode destruir um manuscrito mas é necessário um bom acadêmico para criar um manuscrito"), David Drubin (Editor in Chief da Molecular Biology of the Cell), apresenta as 10 regras para se avaliar um manuscrito submetido à MBoC.



Seguem abaixo:

1. Review a manuscript only if you can do so objectively



2. Review a manuscript only if you can do so in a timely manner



3. Understand your role



4. Recognize the authors’ efforts and the merits of the work while being clear in identifying faults



5. Be critical, but be constructive



6. Be judicious in suggesting additional work



7. Leave it to future generations to judge a manuscript’s impact



8. Be a champion for your field



9. Remember that it is not your paper



10. Be a good role model



Aos os autores, David recomenda: tentar sempre publicar os melhores artigos possíveis. É importante aceitar que o processo de revisão existe para ajudar os autores a chegarem neste objetivo. Receber crítica é difícil mas os autores podem tornar as críticas dos revisores algo construtivo (Vai que é tua, Poliana!). Pergunte-se: os revisores levantaram pontos válidos que podem ser respondidos e, assim, melhorar o trabalho? Se os revisores não perceberam algo, reveja se estes aparecem de maneira clara. Após uma análise honesta da revisão recebida e se você acha que erros foram cometidos na avaliação do manuscrito, defenda sua posição escrevendo um rebuttal atencioso, baseado em evidência.



Opinião pessoal: chá de camomila ajuda os autores a pensarem exatamente da maneira sugerida acima.

segunda-feira, 27 de junho de 2011

O tratamento anti-retroviral pode estar associado ao envelhecimento precoce



ResearchBlogging.org

Post de Theolis Bessa


Senescência acelerada tem sido descrita em pacientes com tratamento bem sucedido da infecção pelo vírus da imunodeficiência humana (HIV). Neste trabalho recém-publicado na Nature Genetics o grupo de Patrick Chinnery mostra que há um acúmulo de mutações associadas ao envelhecimento no DNA mitocondrial de fibras musculares de pacientes tratados com drogas anti-retrovirais inibidoras da transcriptase reversa análogas de nucleosídeos (NRTIs), o que leva a defeitos na fosforilação oxidativa mitocondrial com diminuição da expressão da citocromo c oxidase–succinato desidrogenase (COX), de forma semelhante ao observado em idosos saudáveis. A gravidade do efeito sobre a COX mostrou ser cumulativa em relação ao tempo de exposição ao tratamento com NRTI, implicando a ocorrência de um defeito mitocondrial persistente e cumulativo. Os autores sugerem que a replicação acelerada do DNA mitocondrial em presença dessas drogas pode favorecer o acúmulo de mutações e consequentemente a senescência nos indivíduos expostos ao tratamento.

Referência:

Payne, B., Wilson, I., Hateley, C., Horvath, R., Santibanez-Koref, M., Samuels, D., Price, D., & Chinnery, P. (2011). Mitochondrial aging is accelerated by anti-retroviral therapy through the clonal expansion of mtDNA mutations Nature Genetics DOI: 10.1038/ng.863

quinta-feira, 23 de junho de 2011

World Health Report 2012: o cuidado à saúde deve ser embasado em pesquisa

Post de Theolis Bessa

O World Health Report (WHR) de 2012 terá como tema "não há saúde sem pesquisa". Pela primeira vez o relatório sublinha a necessidade de que o cuidado à saúde pelos órgãos governamentais seja fundamentado em pesquisas clínicas. A partir desta iniciativa a PloS Medicine está encorajando a submissão para a revista de artigos sobre o tema, os quais irão integrar uma coleção especial. São solicitados artigos especialmente de países em desenvolvimento relacionados ao fortalecimento de funções e componentes dos sistemas nacionais de pesquisa em saúde. Os detalhes podem ser encontrados aqui.

quarta-feira, 22 de junho de 2011

Fish and Chip (DNA microarray Chip)

Para aqueles preocupados com a sustentatibilidade, comer peixe pode deixar um gosto ruim na boca. Uma em cada 4 fisheries (local onde as frotas pesqueiras atuam, em tradução livre) entrou em colapso nos últimos 50 anos. A Marine Conservation Society, localizada na Grã-Bretanha, formulou uma série de indicativos sobre quais peixes podem ou não podem ser ingeridos. Por exemplo, o bacalhau pescado no Ártico, no oeste do Báltico ou na Islândia é adequado enquanto que o bacalhau do Platô Faroe não é recomendado.

O problema é saber de onde veio a pesca. As peixarias não têm idéia de onde veio o peixe, somente o próprio pescador pode saber a fonte e, certamente, têm receio de informar, pois a pesca ilegal está crescendo. Dois terços do bacalhau pescado no Atlântico Norte não são informados. Uma vez que os limites para o tamanho mínimo do peixe e para a quantidade da pesca variam em cada região, de acordo com a saúde dos cardumes, os pescadores freqüentemente não informam o verdadeiro local da pesca. Para complicar ainda mais, alguns exemplares da mesma espécie valem mais que outros. O bacalhau do Báltico tem menor valor do que o bacalhau do Atlântico pois a qualidade da carne é menor e o nível de contaminantes é maior.

Para resolver esta questão, um consórcio Europeu (FishPopTrace) desenvolveu um microarranjo de DNA que pode fazer o rastreamento o peixe e, portanto, pode identificar exatamente onde ele foi pescado. Esses chips (literamente um fish and chip) encontram as diferenças entre as populações de peixes, por meio dos SNPs (single-nucleotide polymorphisms), pequenos fragmentos de DNA que variam entre indivíduos e entre populações. Os pesquisadores do consórcio identificaram os SNPs de espécies de bacalhau, linguado, harenque e pescada, obtidos de diferentes localidades pesqueiras. Desta maneira, o microarranjo permite identificar as populações diferentes, e em última instância, pode-se confrontar a informação fornecida pelas frotas pesqueiras.

O custo do chip está em 10 dólares e deve baratear conforme a tecnologia é desenvolvida. Essa seria a mais nova ferramenta forense no combate contra a pesca ilegal. Uma vez que a molécula de DNA é robusta, o teste pode ser feito em qualquer momento, no ato da pesca, na chegada no porto e até no restaurante. Os fiscais têm mais uma alternativa para os que burlam a lei e os comerciantes mais facilidade para vender o que é certo.

Fonte: The Economist



Para saber mais sobre pesca sustentável, visite o Aquário de Monterey Bay (CA-EUA), que tem um programa espetacular sobre sustentabilidade na pesca.

terça-feira, 21 de junho de 2011

Momento DR (discutindo a relação)

No mês de junho comemora-se o amor (dia dos namorados) e o casamento (dia de Santo Antonio?). Pois bem, nesse clima de romance, segue um texto, escrito por Morgan Giddings, que trata da relação complicada entre a ciência (cientistas) e a sociedade. Giddings faz um paralelo entre o casamento e a relação entre a sociedade e a ciência. Assim como a velha máxima que diz que o casamento é trabalho duro pois precisa de atenção e muita dedicação, a relação entre a ciência e a sociedade também é. Não adianta somente ser cientista, fazer ciência. A sociedade precisa de nossa ajuda (nós, os cientistas), para reconhecer, fomentar e apreciar o que nós fazemos (novamente, os cientistas). Ou seja, esta "relação" (sociedade-ciência/centista) precisa ser trabalhada/discutida (momento DR no Blog).

Se queremos ter o privilégio de continuar a fazer ciência no futuro, com a sociedade pagando a conta, precisamos ensinar a sociedade o valor do que estamos fazendo. De outra forma, corremos o risco dela pedir o divórcio.

Da última vez que alguém perguntou o que você faz, qual foi a resposta? Foi um eterno relato técnico, impossível de ser compreendido? Se sim, vamos esperar que seja a última vez. Abaixo seguem algumas dicas muito boas de como melhorar a nossa comunicação com a sociedade. Isso vai mudar o futuro? Quem sabe? Mas quem fica parado é poste e, assim como no casamento, a gente tem que cuidar de quem nos dá oportunidade, alegria e felicidade.

1. Take time to educate others about the value of your science; the end goals and outcomes that your work strives towards, NOT the minutiae. Yes, I know, you can’t predict whether the work will solve cancer or cure HIV/AIDS, but if you aren’t willing to connect the dots between your work and the ultimate outcomes, why do you expect society to keep paying for it? It probably won’t.

2. Realize that doing science is much like driving: it’s a privilege, not a right!

3. From time to time do some introspection. Ask yourself, how does this work benefit the world, or humanity? Make the work matter, rather than just doing it for fun (or better yet, find out how you can have fun and make the work matter). A businessman I once talked to said, “I’d love to sit around and play guitar all day, but I can’t figure out how to get anyone to pay me to do that, which is why I’m in business.” You’ve been lucky to have someone supporting you, but realize that could stop at any time.

4. Drop the utter cynicism about the grant funding game, and realize that most agencies try to do their best to solve real problems with limited resources. Instead of wasting energy on cynicism, spend that energy figuring out how to solve important problems (last I checked, there were still plenty).

5. Take time out to educate youngsters about science. At many public elementary schools, science education is now a part-time thing, just one or two days a week. It is pathetic, and overburdened schools need volunteers who understand science.


Fonte: Naturally Selected

segunda-feira, 20 de junho de 2011

O coração da ciência está doente

“I think measurement, assessment and evaluation lie at the heart of the problem. Once you start counting papers, scoring journals and measuring impact then the purposes of publication change.”
Este trecho bastante significativo marca o tom da entrevista “The Heart of Research is Sick” de Peter Lawrence, (Cambridge).  O ponto fundamental é a crítica que o sistema de publicação se tornou um sistema de contagem para outros fins (promoção na carreira, obtenção de financiamento, e.g.) e se afastou do fundamental: a comunicação científica, o relato de dados importantes.
Há vários outros aspectos interessantes: “there is a growing irre- sponsibility with citations in journals, of not giving credit to others.”.
O arquivo (pdf) da entrevista completa pode ser baixado aqui.

domingo, 19 de junho de 2011

Escola Politécnica oferece curso sobre redes neurais artificiais

Inscrições ficam abertas até o dia 30 de junho
Com os objetivos de apresentar conceitos fundamentais sobre Redes Neurais e suas aplicações, especialmente dedicadas à Engenharia Biomédica, e os modelos aplicados à área da Saúde, a Escola Politécnica da UFBA promove, através do Núcleo de Serviços Tecnológicos (NST), o curso “Redes neurais artificiais”. As atividades serão realizadas de 4 a 9 de julho, na própria Politécnica, e as inscrições já se encontram abertas no NST até o dia 30 de junho. Podem participar profissionais pesquisadores, pós-graduandos e estudantes das engenharias, Física, Química, Saúde Coletiva, Matemática, Computação, Sistemas de Informação, Biotecnologia, Engenharia Biomédica ou Clínica e de outras áreas afins.
Redes Neurais Artificiais são técnicas computacionais que apresentam um modelo matemático inspirado na estrutura neural de organismos inteligentes e que adquirem conhecimento através da experiência. Constituem um método para solucionar problemas usando técnicas de treinamento, ou seja, aprendendo errando e fazendo descobertas, adquirindo conhecimentos através da experiência. Trata-se de um conceito de extrema importância em computação, responsável pela solução de problemas complexos que vão, por exemplo, de análise e processamento de sinais à avaliação de crédito, da análise de voz ao diagnóstico diferencial de doenças.
As aulas, de segunda a sábado, das 8 às 11h30, serão ministradas pelo Dr. Flávio Fonseca Nobre, PhD, Professor Titular da COPPE/UFRJ e doutorado em Engenharia Biomédica pelo Imperial College of Science and Technology, de Londres, UK. O NST fica no 8.º andar da Escola Politécnica, localizada na Rua Aristides Novis, 2 – Federação. Mais informações podem ser obtidas pelo telefax 3283-9860 ou pelo e-mail nst@ufba.br

sábado, 18 de junho de 2011

Como ser um pesquisador com publicações de alto impacto científico?


Post de Vitor RR de Mendonça
publicado originalmente no SBlogI
ResearchBlogging.org
Já teve a desagradável sensação de um paper ser rejeitado por uma revista de alto impacto? Como proceder para publicar sempre nos melhores periódicos? As vezes se pergunta o porquê de alguns pesquisadores sempre terem seus artigos nas revistas mais conceituadas?
No ano passado foi publicado por Zelko et al. na Plos One um trabalho interessante entitulado “Selection Mechanisms Underlying High Impact Biomedical Research - A Qualitative Analysis and Causal Model” tratanto exatamente desses questionamentos. O objetivo desse estudo foi investigar um grupo de pesquisadores da área biomédica com um alto impacto nos seus trabalhos científicos, procurando por padrões consistentes de comportamento através do tempo ou heurísticas que possam explicar o seu sucesso. Aqueles não familiarizados à pesquisa qualitativa (e me incluo), heurística consiste em um grupo de regras que guia o indivíduo pesquisador no que fazer ou não fazer. 
Foram realizadas entrevistas pelo telefone com pesquisadores de alto impacto (n=13) do mundo inteiro. Considerou-se alto impacto aqueles pesquisadores tendo 5 ou mais publicações “peer reviewed” com um impacto maior que 300 ou um índice-H de 50 ou mais. O método “Ground theory” para estudos qualitativos foi usado para decodificar cada entrevista, organizando os conceitos e categorias em um modelo geral de explicação através dos temas emergentes. Este modelo então foi traduzido para um modelo matemático “System Dynamic” para representar a sua estrutura e comportamento.
Cinco principais temas relacionados ao alto impacto científico emergiram da análise das entrevistas:
  1. Heurísticas: guiam o desenvolvimento de novas idéias, são variáveis e difíceis de comparar. Cada pesquisador tem sua heurística principal. Alguns exemplos são: método da tentativa e erro, até que algum resultado seja inesperado ou novo; processo de planejamento passo a passo; identificação de dúvidas científicas através de intensa revisão da literatura; idéias com aplicações práticas; trabalhos demorados e árduos em que ninguém se aventuraria.
  2. Feedback dos mentores e revisores contribuem para a seleção e desenvolvimento das heurísticas.
  3. Feedback para o público através da apresentação de novas idéias por meio de publicações e apresentações científicas possibilitam um aperfeiçoamento das heurísticas. Boa comunicação é uma característica chave.
  4. Atributos psicológicos como curiosidade e mente aberta, que constantemente motivam mesmo quando situações desestimulantes são encontradas.
  5. O sistema é dominado pela aleatoridade e sorte, e isto está longe de uma natureza linear e previsível. 
A união desses temas emergentes através do “System Dynamic” resultou em um modelo causal representado pelos comportamentos esperados pelas publicações e o impacto alcançado nos pesquisadores de alto impacto (figura acima). Na figura os loops em R representam os “reinforcing loops” e os B, “balancing loops”.
Baseado nos achados deste trabalho, alto impacto não é alcançado apenas intencionalmente, mas também pela presença de um grupo de habilidades inerentes aos pesquisadores em identificar lacunas e nichos estratégicos que podem resultar em alto impacto. 
Respondendo à pergunta do título, para ser um pesquisador de alto impacto científico, busque a heurística mais funcional e adequada ao seu padrão de personalidade, e conte com a sorte! Como vos falo da Bahia; vai uma fitinha do Senhor do Bonfim?!
Zelko, H., Zammar, G., Bonilauri Ferreira, A., Phadtare, A., Shah, J., & Pietrobon, R. (2010). Selection Mechanisms Underlying High Impact Biomedical Research - A Qualitative Analysis and Causal Model PLoS ONE, 5 (5) DOI: 10.1371/journal.pone.0010535
Foto das fitas do site O que é isso?

sexta-feira, 17 de junho de 2011

Prof. Barral divulga programa "Ciência sem fronteiras", nos EUA.

Brazilian Immunologist/Educator to Visit UC Davis Campus June 20 to Launch 'Science Without Borders' Project
June 13, 2011

Noted immunologist Manoel Barral, director of the Institutional Collaboration at CNPq, the Brazilian equivalent of the National Science Foundation/National Institutes of Health, will be on campus Monday, June 20 to launch a "Science Without Borders" project.

A renowned immunologist and educator who directs the Brazilian equivalent of the National Science Foundation in the United States will launch a long-range “Science without Borders” project with the University of California, Davis, on Monday, June 20, when he will meet with administrative officials, tour the Genome Center, and deliver a noon presentation at Mrak Hall to the campus community.

Professor Manoel Barral, director of Institutional Collaboration at CNPq, the Brazilian equivalent of the National Science Foundation/National Institutes of Health, will be on campus at a series of all-day meetings.

CNPq is an organization of the Brazilian federal government under the Ministry of Science and Technology, and is dedicated to scientific and technological research.

“The main goal is to promote the consolidation and expansion of science, technology and innovation in Brazil through international exchange and mobility,” said host Walter Leal, professor and former chair of the UC Davis Department of Entomology.


Walter Leal will host the Barral visit.
Leal, a chemical ecologist and native of Brazil, said the project is a two-way mobility program involving undergraduate, graduate and postdoctoral students. Research will encompass engineering, earth sciences, health and biomedical sciences, aerospace, pharmaceuticals, sustainable agriculture production, green chemistry, energy, biotechnology, climate change, minerals, biodiversity, marine sciences, and housing and sanitation, among others.

Barral is stopping at Davis before heading to Washington, D.C. to speak at the EducationUSA Forum.

While here, Barral will discuss the “Science Without Borders” project with Provost and Executive Vice Chancellor Ralph Hexter; meet with Satya Dandekar, professor and chair of Microbiology and Immunology and tour the Genome Center; meet with Associate Vice Provost Adrienne Martin, University Outreach and International Programs; and meet with Jeffrey Gibeling, dean of Graduate Studies, regarding the collaboration and agreement.

Barral will speak on “An Overview of the Brazilian Science and Technology System” at a open seminar for the campus community from 12:15 to 1 p.m., in 203 Mrak Hall. Leal will introduce Barral. A question-and-answer session will follow. The event is co-sponsored by the University Outreach and International Programs and the Department of Entomology.

Following lunch, Barral will join faculty, students and scholars with Brazilian linkages for an hour-long meeting in 1022 Life Sciences Addition (LSA) . The campus has about 70 students and scholars with Brazilian linkages.

Mais informações aqui

quinta-feira, 16 de junho de 2011

Ensaios Clínicos Pragmáticos na avaliação de Testes Diagnósticos em Doenças Infecciosas

Post de Theolis Bessa

O Centro de Pesquisa em Tuberculose do Hospital Universitário Clementino Fraga Filho/UFRJ, em colaboração com o Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde/Fiocruz realizam o Curso de Ensaios Clínicos Pragmáticos na avaliação de Testes Diagnósticos em Doenças Infecciosas. As inscrições devem ser feitas presencialmente na secretaria do Centro de Pesquisa em Tuberculose nos dias 18 e 20 de julho. Para maiores informações pode-se contactar pelo telefone (21) 3865-5112.


Coordenadores:
Afrânio Kritski e Gisele Huf.

Pré-requisitos para obtenção do certificado: Para o inscrição isolada não há pré-requisitos, mas para candidatar-se ao certificado de conclusão final o aluno necessita ter cursado a disciplina de epidemiologia.

Duração: O curso completo totaliza 30h

Horário e local: As aulas serão ministradas no INCQS- Fiocruz e no Programa Pós-Graduação Clinica Médica -FM-UFRJ/HUCFF às terças e quintas na horário de 9 às 12h

Início: 02/08/2011

Término: 01/09/2011

Apresentação: O tempo durante o qual o paciente portador de uma enfermidade infecciosa mantém a cadeia de transmissibilidade tem sido apontado como um dos principais fatores de perpetuação da doença. Neste contexto, novas ferramentas para o diagnóstico têm sido aprovadas pelas agências regulamentadoras e sua incorporação ao sistema de saúde costuma ser quase imediata. As intervenções na área da saúde têm sido cada vez mais avaliadas não apenas quanto à possibilidade de produzir efeitos benéficos (ensaios clínicos explanatórios), mas também em estudos que possam amparar uma tomada de decisão (ensaios clínicos pragmáticos). Este curso irá desenvolver a aplicação prática destes conceitos para a avaliação de novas técnicas diagnósticas, com ênfase na detecção da tuberculose.

Bibliografia:

1. Gordis, L. Epidemiology. Elsevier-Saunders, Philadelphia, 3a. Ed., 2004.
2. Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions.
3. Artigos publicados serão recomendados no decorrer do curso.

Programa:

Aula 1:

Apresentação da curso.
A lógica dos testes diagnósticos

Aula 2:
A lógica dos ensaios clínicos pragmáticos

Aula 3:
Revisões sistemáticas

Aula 4:
Metanálise

Aula 5:
Os novos testes diagnósticos para detecção de tuberculose e tuberculose resistente

Aula 6:
Os desafios no desenho de ensaios clínicos pragmáticos na avaliação de testes diagnósticos

Aula 7:
A condução e gerenciamento de ensaios clínicos pragmáticos na avaliação de testes diagnósticos (I)

Aula 8:
A condução e gerenciamento de ensaios clínicos pragmáticos na avaliação de testes diagnósticos (II)

Aula 9:
Análise de dados. Epi-info e SPSS.

Aula 10:
A publicação do protocolo e dos resultados

quarta-feira, 15 de junho de 2011

Visualização de leishmanias híbridas fluorescentes

Post de Leonardo Arruda
A reprodução de parasitas do gênero leishmania até pouco tempo atrás era considerada exclusivamente assexuada ou clonal. Nunca foi observado nenhum tipo de dimorfismo sexual tão pouco se pode comparar cromossomos, pois estes nunca se condensam durante a divisão celular.
Em 2009, foi demonstrada a troca genética entre parasitas, ao obter-se leishmanias resistentes a duas drogas, co-infectando o vetor com duas cepas resistentes cada uma a uma droga (aqui). 
Com uma nova abordagem para observar os eventos de recombinação, um grupo europeu publicou a alguns dias no Plos One, trabalho onde co-infectaram duas espécies diferentes de vetores (Lutzomia longipalpis e Phlebotomus perniciosus) com cepas transgênicas de Leishmania donovani que expressavam genes de resistência (higromicina ou neomicina) e dois marcadores de fluorescência (verde ou vermelho). Após repasto sanguíneo com as duas cepas, as fêmeas foram dissecadas em diferentes tempos e examinadas por microscopia de fluorescências ou FACS seguido de microscopia confocal.
Parasitas híbridos foram visualizados em ambos os vetores estudados após dois dias do repasto com as duas cepas Figs. 1 e 2. Infelizmente os autores não foram capazes de expandir estes parasitas em cultura. 

Fig. 1 – Parasitas recombinantes com duas fluorescências em C
Fig 2. Parasitas isolados por FACS.
A partir destes dados os autores reafirmaram o fenômeno da troca genética entre diferentes cepas e especularam sobre suas implicações epidemiológicas, em especial ao que se refere ao crescente aparecimento de cepas resistentes a drogas. 
Apesar da freqüência natural de ocorrência deste fenômeno ser raríssima, com o inseto fazendo seu repasto sanguíneo em dois hospedeiros portadores de cepas não isogênicas, seguido pela troca do material genético entre as cepas, já foram descritos híbridos L. braziliensis/L. peruviana no Perú (aqui). Mais ainda, híbridos de L. major/L. infantum foram encontrados no vetor Phlebotomus papatasi, vetor este que normalmente não suporta L. infantum (aqui). 
Infelizmente, a maquinaria que o parasita utiliza para efetuar este intercâmbio de material genético continua sem definição. Sabemos que as leishmanias fazem sexo ao seu modo, mas ainda temos muito que aprender sobre suas preferências e hábitos sexuais.
O artigo completo pode ser visualizado gratuitamente aqui.

terça-feira, 14 de junho de 2011

Regulação mediada pelo hospedeiro da superinfecção na malária

ResearchBlogging.org


Vitor R R de Mendonça

Após publicar sobre os efeitos benéficos do CO na proteção contra a malária cerebral na Nature Medicine em 2007, o grupo da Maria Mota continua ganhando notoriedade na comunidade científica malariologista ao emplacar este ano outro trabalho no mesmo periódico. Entitulado “Host-mediated regulation of superinfection in malaria”, o trabalho traz novos dados sobre a influência da fase sanguínea do plasmódio na prevenção da superinfecção.

Camundongos foram infectados com Plasmodium berghei (e outras espécies) e após a parasitemia ter desenvolvido, os mesmos animais foram reinfectados com o parasita expressando luciferase, para distinguir entre a infecção original e a subsequente. Percebeu-se que, independente da espécie do parasita, a forma eritrocítica da malária inibe a reinfecção, visto através da ausência de expressão da luciferase nos hepatócitos.

Após essa descoberta, os autores resolveram compreender qual seria o mecanismo que estaria levando a inibição do desenvolvimento da nova infecção. Uma análise genômica por microarray foi realizado para identificar os possíveis genes relacionados a esta inibição. Mecanismos da imunidade adaptativa ou apoptose foram descartados após diversos experimentos. O próximo passo para explicar a redução do número e tamanho das formas exoeritrocíticas do plasmódio seria a presença ou ausência de algum nutriente ou fator de crescimento que poderia estar limitando o desenvolvimento do estágio hepático da doença.

Percebeu-se que o Hamp, o gene que codifica a hepcidina (hormônio regulador do ferro) está significativamente maior expresso no fígado de camundongos com o estágio eritrocítico da malária. A hepcidina regula a homeostase e distribuição do ferro através da degradação do exportador do ferro (ferroportina), assim prevenindo a liberação para o plasma do ferro reciclado dos eritrócitos e da dieta pelos macrófagos e enterócitos que expressam ferroportina, respectivamente. Sabendo que a aquisição ou retenção do ferro pode ser essencial para o completo desenvolvimento do Plasmodium dentro das células do hospdereiro, a diminuição do ferro nos hepatócitos decorrente do aumento da hepcidina, resulta em uma inibição no desenvolvimento do parasita.

O papel do ferro no desenvolvimento do parasita foi confirmado por um “clinical trial” em que houve suplementação de ferro em crianças menores de 5 anos da Tanzânia, onde a malária é altamente endêmica. Demonstrou-se um aumento significativo nas infecções pela malária e no risco de morte nas crianças que receberam o ferro.

Os resultados pioneiros deste trabalho elucidam o papel do binômio ferro/hepcidina na infecção pelo plasmódio e apontam novas perspectivas para uma possível terapia e/ou prevenção contra à superinfecção da malária. No “Workshop on Innate Immunity and Malaria”, que ocorreu em Belo Horizonte entre 8 e 9 de junho de 2011, Maria Mota apresentou seus novos resultados. Segundo a pesquisadora, antes de desenvolver a forma eritrocítica da infecção, o parasita já na fase hepática garante uma proteção contra uma nova infecção provavelmente através de um mecanismo envolvendo o IFN-alfa. Aguardemos que, em breve, teremos mais um trabalho de alto impacto científico do grupo Mota.




Portugal, S., Carret, C., Recker, M., Armitage, A., Gonçalves, L., Epiphanio, S., Sullivan, D., Roy, C., Newbold, C., Drakesmith, H., & Mota, M. (2011). Host-mediated regulation of superinfection in malaria Nature Medicine DOI: 10.1038/nm.2368

segunda-feira, 13 de junho de 2011

Bloqueio da Transmissão da malária falciparum com drogas: propriedades gametocidas e esporontocidas de antimaláricos atuais e prospectivos



Fonte: Wikipedia

ResearchBlogging.org


Post de Alene Vanessa Azevedo dos Santos

A malária é uma doença infecciosa causada pelo protozoário parasita Plasmodium sp. Ela é endêmica em 90 países, nos quais vivem aproximadamente 2,4 milhões de pessoas, isso representa 40% da população mundial em área de risco. Dados da Organização Mundial da Saúde indicam que uma criança morre em decorrência da malária a cada 30 segundos. Em 2008 ocorreram aproximadamente 243 milhões de casos de malária, causando aproximadamente 863 mil mortes, grande parte dessas em crianças africanas.

A malária é uma doença tratável. Entretanto, desde os anos 50 já existem relatos de resistência do parasito ao tratamento. Essa resistência tem se tornado o principal problema no controle da malária. Resistência in vivo já foi reportada para todos os medicamentos utilizados no tratamento inclusive, atualmente vem sendo descrito a redução da sensibilidade de pacientes ao tratamento com artemisinina. Na tentativa de minimizar os riscos de seleção de cepas resistentes, a OMS preconiza que o tratamento da malária seja sempre em combinação. Atualmente, a artemisinina e seus derivados são as drogas indicadas para combinação com outras substâncias.

Vários estudos vêm se dedicando a descoberta de novas drogas efetivas no tratamento da malária. Entretanto, os esforços estão concentrados nas formas assexuadas do parasito as quais são as principais responsáveis pelos sintomas agudos da doença, enquanto que poucas terapias são efetivas contra os estágios gametocíticos do plasmódio. É importante entender que drogas que sejam efetivas sobre formas sexuais ou que impeçam a esporogonia não beneficiarão diretamente o paciente em tratamento, mas diminuirão bastante as chances desse paciente transmitir o parasito para o mosquito e consequentemente para outras pessoas da comunidade, o que culminará com um decréscimo nas reinfecções. Drogas que diminuam a transmissão da doença atuarão de forma sinergística com programas efetivos de intervenção antimalárica. Sendo assim, o objetivo dessa revisão foi examinar a natureza de algumas das drogas com atividade gametocitocida mais promissoras no bloqueio da transmissão da doença.

O autor discute as vantagens de novas 8-aminoquinolinas, como a Tafenoquina, que possui uma meia vida muito superior, é menos tóxica e clinicamente mais efetiva em comparação à primaquina, e dentre os antimaláricos é a única que possui atividade contra todas as formas evolutivas do parasito, inclusive contra esquizontes hepáticos. Trioxaquinas, quimeras covalentes que combinam trioxanos tóxicos ao parasito com aminoquinolinas que acumulam dentro dos parasitos, são eficazes tanto contra gametócitos em estágios iniciais quanto contra estágios maduros, em concentrações melhores que o próprio artesunato (derivado da artemisinina).Outro dado interessante sobre trioxaquina é que um derivado da mesma apresentou IC50 de 10nM quando utilizada em cepas resistentes à cloroquina. Esses compostos ainda não foram testados em humanos, entretanto, camundongos tratados com as substâncias apresentaram cura da parasitemia e têm sido determinados níveis tóxicos menores quando comparado com outras terapias. A Epoxomicina, um derivado natural de Actinomycetes, mostrou completa eliminação dos gametócitos em 72 horas com doses de até 10nM. O azul de metileno, um dos primeiros compostos sintéticos utilizados contra a malária, que age contra redutases e também no processo de detoxificação do heme, quando combinado com o artesunato ou com a amodiaquina é capaz de eliminar completamente os estágios sexuados do parasito.

Nessa busca por atividade contra formas sexuadas da malária, uma série de diferentes alvos vem sendo estudados. Pesquisas recentes mostraram a importância de certas proteínas, por exemplo: Pfs230, Pfs48/45 e Pfs25, associadas a membrana e que são específicas dos gametócitos. Essas proteínas têm sido estudadas, principalmente, quanto a sua capacidade antigênica para serem usadas em vacinas que possivelmente bloqueiem a transmissão. Dentre as moléculas que possivelmente atuem na gametocitogênese, gametogênese e espeorogonia estão: proteases, proteínas cinases, peroxiredoxinas, efetores da sinalização cGMP, corpos osmiofílicos, receptores e ligantes envolvidos com adesão e seqüestro.

Diante do exposto, ainda não foi desenvolvida nenhuma droga antimalárica ideal que atue inibindo ou bloqueando a transmissão da doença, essa deveria ter atividade tanto contra formas sexuadas quanto contra formas assexuadas. Entretanto, os dados acima indicam que algum progresso está sendo realizado nesta área. Evidências sugerem que monoterapias baseadas em droga gametocidas com baixa atividade contra estágios assexuados têm acelerado a resistência como parte da seleção natural. Baseado no exposto, drogas que sejam ativas contra foras sexuadas do parasito colaboram com a diminuição da resistência quando utilizadas em terapias combinadas.

Sendo assim, esse tipo de drogas surge como uma alternativa para utilização em combinação com outras drogas e atuando a partir da redução da quantidade de inóculo disponível para os vetores, drogas gametocitocidas surgem como complementares na tentativa de eliminar a malária.

Referência:

Kiszewski, A. (2010). Blocking Plasmodium falciparum Malaria Transmission with Drugs: The Gametocytocidal and Sporontocidal Properties of Current and Prospective Antimalarials Pharmaceuticals, 4 (1), 44-68 DOI: 10.3390/ph4010044

sábado, 11 de junho de 2011

Oportunidades de fomento


Edital DRI/CGCI nº 16/2011 - Programa Capes/Marca: Mobilidade Docente
Edital DRI/CGCI nº 16/2011 visa apoiar projetos de parcerias universitárias, em nível de graduação, de instituições participantes do Programa Marca devidamente reconhecidas pelos respectivos sistemas educacionais. O Programa Marca tem como objetivos: contribuir para o fortalecimento da capacidade docente; estimular a aproximação das estruturas curriculares e o reconhecimento mútuo de créditos obtidos nas instituições participantes do Programa Marca; propiciar a troca de experiências em metodologias de ensino; e itensificar o intercâmbio cultural dos países envolvidos. 
No Brasil, a instituição responsável pelo programa é a Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes), Ministério da Educação (MEC). Informações dos demais países podem ser encontradas nos seguintes linksArgentinaParaguaiUruguai, e Chile.
Data Limite: Inscrição das propostas: até 30 de junho de 2011. Home Page: Edital DRI/CGCI nº 16/2011 - Programa Capes/MARCA: Mobilidade Docente


MFPL Vienna International Post-Doctoral Training in Molecular Life Sciences 2011
The Max F. Perutz Laboratories (MFPL) at the Campus Vienna Biocenter were established to form a new research institute in the field of biotechnology with groups from the University of Vienna and the Medical University of Vienna. The MFPL has a strong focus on promotion of young scientists, cooperation across the campus and other research institutes as well as companies and intends to set up central scientific services. The main aim for the MFPL to become a Center of Excellence in the Life Sciences during the next decades.  The mission of the Vienna International Post-Doctoral Training in Molecular Life Sciences (VIPS) is to offer an excellent environment to post-doctoral scientists and to support them on their way to scientific independence. The VIPS offer a broad coverage of research areas, ranging from Biochemistry, Cellular Biology, Immunobiology to Organismal Biology, Bioinformatics, Structural Biology and Neurosciences.
Data Limite: The online submission is open until 30th of June 2011 (23:59 CEST). Home Page: http://www.projects.mfpl.ac.at/vips/index.php?mid=1&smid=2&1_section=1&1_id=1&1_mode=


TWAS Support for International Scientific Meetings
The Academy of Science for the Developing World (TWAS) has been supporting scientists and institutions in developing countries through a wide range of programmes including supporting scientific meetings organized in developing countries. With funds provided by the Italian government, TWAS encourages the organization of high level international and regional scientific activities in developing countries by offering financial assistance to the organizers of conferences, workshops, symposia and special meetings held in these countries.
Grants are offered for meetings in the following fields of natural sciences: agricultural, biological, chemical, engineering, geological and medical sciences.
Data Limite:
1 June: for meetings to be held during January-June of the following year; 
1 December: for meetings to be held during July-December of the following year. 
Home Page: http://twas.ictp.it/prog/meetings/support-for-international-scientific-meetings


ESCV Travel Grants 2011
The purpose and aims of the European Society for Clinical Virology (ESCV) is together scientists and clinicians to promote Public Health and advance education, particularly medical education, in Clinical and Basic Virology. ESCV is very pleased to invite you to the 14th ESCV Annual Meeting, in Funchal, Madeira, Portugal, of 21-24 September 2011. This meeting will cover hot topics of clinical virology, as well as a wide range of other themes, from fundamental research to epidemiology, diagnosis, prevention and therapy, maintaining the high scientific standards of previous meetings of this Society. ESCV wishes to offer a number of travel grants to young researchers to enable them to attend this meeting.
Data Limite: Application should be submitted by e-mail at the time of abstract submission. The deadline for abstract submission is June 15, 2011. Home Page: http://www.escv.org/travel/travelGrants.asp


Weill Cornell Graduate School of Medical Sciences - PhD Fellowships
The Weill Graduate School of Medical Sciences is unique among peer institutions because it is integrated within a world-class medical center. The students work on the leading edge of biomedical research learning first hand how breakthroughs at the bench translate into new therapies for diseases. Applications to the Weill Cornell Graduate School of Medical Sciences (WCGS) are accepted in seven programs of study for the degree of Doctor of Philosophy (PhD). Students may apply to one of the following predoctoral programs:
4.       Molecular Biology;
5.       Neuroscience;
6.       Pharmacology;
Data Limite: December 1 is the deadline for applications. Home Page: http://weill.cornell.edu/gradschool/apply_online/index.html


DIES - Partnerships with Higher Education Institutions in Developing Countries
The German Academic Exchange Service (DAAD) is the largest funding organisation in the world supporting the international exchange of students and scholars. The DAAD runs over 250 programmes, through which it funds more than 74,000 German and foreign scholars worldwide per annum. Dialogue on Innovative Higher Education Strategies (DIES), this programme area jointly developed by the DAAD and HRK aims at an international exchange of experience in matters of innovative higher education management and policy. DIES Partnerships support co-operation in university management between higher education institutions in industrialised and developing countries. 
DIES promotes dialogue on innovative strategies in higher education and fosters partnerships between German institutions and developing countries, including Brazil. Developed from a cooperation between the DAAD and the HRK (Conference of Rectors of German Universities), the DIES is funded by the Ministry of Economic Cooperation and Development (BMZ). The program provides funding for training courses, events, dialogue, projects and partnerships with which higher education institutions in developing countries can align their training programs in accordance with international quality standards, and expand its research capabilities and develop competitively their organizational structures.
Data Limite: The deadline for applications within this call for proposals is the 30st of June 2011, the earliest funding will be January 2012. Home Page: http://rio.daad.de/shared/programas_especiais.htm


 ASM Infectious Disease (ID) Fellow Travel Grants
The American Society for Microbiology (ASM) is the oldest and largest single life science membership organization in the world. Membership has grown from 59 scientists in 1899 to more than 43,000 members today, with more than one third located outside the United States. The members represent 26 disciplines of microbiological specialization plus a division for microbiology educators. The Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy (ICAAC) Program Committee will award a limited amount of Travel Grants to support the Travel of Infectious Disease Fellows to the 51st ICAAC. The 2011 ICAAC will be held in Chicago, Illinois, September 17 - 20, 2011.
Data Limite: Letter of nomination, Application Form, and copy of abstract(s) are due July 1, 2011 (received by). Home Page: http://www.icaac.org/index.php/scientific-program/travel-grants


ASM/ICAAC Student and Post Doctoral Fellow Travel Grant
The American Society for Microbiology (ASM) is the oldest and largest single life science membership organization in the world. Membership has grown from 59 scientists in 1899 to more than 43,000 members today, with more than one third located outside the United States. The members represent 26 disciplines of microbiological specialization plus a division for microbiology educators. 
In 2005, ASM expanded opportunities for Infectious Disease Fellows and created the Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy (ICAAC) ID Fellows Grant Program and students who submit abstracts can request travel support funds. Travel Grants are selected by the Program Committee on the basis of the scientific quality of the submitted abstracts. The 
2011 ICAAC will be held in Chicago, Illinois, September 17 - 20, 2011.
Data Limite: Letter of nomination, Application Form, and copy of abstract(s) are due July 1, 2011 (received by
Home Page: http://www.icaac.org/index.php/scientific-program/travel-grants#ASM Student and Post Doctoral Fellow Travel Grant


HIV/AIDS Implementation Science Targeting Drug Using Populations: A Collaboration with PEPFAR (R01)
This initiative solicits research to evaluate the effectiveness and cost-effectiveness of various models of program integration to prevent the further spread of HIV among persons who use drugs, including poly-substance users that will result in greater availability, expanded access, lower-threshold regulations facilitating use of services and reducing the burden of disease. It will support regional collaborations, across countries in the same region of the world as well as within countries (e.g., multiple provinces or cities) and among sub-populations within countries. 
This initiative is aimed at developing research and program capability such as initiating and/or scaling up capacity to capture, analyze, and disseminate data. In doing so, applicants are encouraged to leverage existing international resources. Because sustainability and country ownership of programs is a goal of PEPFAR programs, it is essential that applicants provide training to local partners/collaborators to facilitate sustainability and engage where feasible, governmental and civil society sectors.
Data Limite: Letter of Intent Due Date: July 1, 2011 
Application Due Date(s): August 1, 2011.
Home Page: http://grants.nih.gov/grants/guide/rfa-files/RFA-DA-12-002.html

Global Infectious Disease Research Training Program (D43)
The Fogarty International Center (FIC) is dedicated to advancing the mission of the NIH by supporting and facilitating global health research conducted by U.S. and international investigators, building partnerships between health research institutions in the U.S. and abroad, and training the next generation of scientists to address global health needs.Through this Funding Opportunity Announcement (FOA), the FIC encourages renewal and new applications for the Global Infectious Disease Research Training Program. The application must propose a collaborative research training program that will strengthen the capacity of institutions in low-and middle-income countries (LMIC) to conduct infectious disease (excluding HIV/AIDS) research. 

FIC will support research-training programs that focus on major endemic or life-threatening emerging infectious diseases, neglected tropical diseases, widespread co-infections of HIV/AIDS patients or infections associated with non-communicable disease conditions of poverty in developing countries. Please see the 
Global Health Initiative for details.
Data Limite: Next Letters of Intent Receipt Date(s): August 21, 2011 and August 21, 2012. 
Next Application Due Date(s): September 21, 2011 and September 21, 2012.
Home Page: http://grants.nih.gov/grants/guide/pa-files/PAR-10-260.html

Fomento e Infraestrutura em P&DT
Coordenação de Pesquisas -Vice-Diretoria de Pesquisas e Desenvolvimento Tecnológico
Fiocruz Bahia